אינטואיציה ומדע מודרני

שלום הרב מיכאל,
קראתי לא מזמן את ספרך 'אמת ולא יציב'. נהניתי מהקריאה וזה נתן לי הרבה חומר למחשבה. תודה רבה.
אתה טוען בספר שהכלי שלנו כדי להכריע מהי האמת הוא האינטואיציה. שילוב בין חשיבה להכרה. הסתכלות ב'עיני השכל' אל האידאות או הרעיונות העומדים מאחורי הדברים והשוואתם כדי לברר מה נכון ומהי האמת (גם אם זה לא וודאי).
לגבי זה עלתה לי שאלה: מהמעט שאני מבין לגבי תורת הקוונטים, תורת היחסות של איינשטין ועוד תיאוריות מודרניות, הן מאוד לא אינטואיטיביות. קשה לתפוס את התיאוריות (הסתברות במיקום האלקטרון, דואליות גל חלקיק, זמן שתלוי במערכת בה אתה נמצא וכו'), קשה להבין למה הדברים עובדים כך וללא הרבה ניסויים עם תוצאות חד משמעיות והרבה מדענים שתומכים בתורות אלה, כנראה שלא היינו מאמינים בהם (בניגוד למכניקה של ניוטון שממה שאני מכיר נראית לי די אינטואיטיבית והגיונית).
עכשיו, מתוך הנחה שאתה אכן מאמין בתיאוריות אלה וגם מבין אותן בצורה טובה בתור פיזיקאי,
זה לא מעלה שאלה לגבי השימוש באינטואיציה ככלי להכרת המציאות?
למשל ניתן לומר שאם האינטואיציות לא עובדות ברמת המיקרו של החומר (קוונטים) או במהירויות מאוד גבוהות- ולכן צריך להסתמך על ניסויים ברורים- אולי הן גם לא יעבדו בנוגע ליצירת העולם או כל דבר שמאוד רחוק מהמציאות שאנו חיים בה. 
האם האינטואיציה שלנו עובדת בדברים שאנחנו לא באמת מכירים?
תודה רבה 🙂