חילוק בין ממון לצער הגוף

בגמרא בבא קמא פרק אחרון מבואר שאם שליח בית דין אומר שהאדם מסרב לבוא לדין מוציאים עליו שמתא 
אבל לא כותבים כי אי אפשר להוציא שכר הסופר על פי הנאמנות הזו איך יתכן שלבייש אדם בזיון עצום
ולכתוב עליו שמתא 
 אפשר על פי שליח בית דין
שרש\"י מבאר שיש חזקה שהוא לא משקר 
ולהוציא פרוטה של שכר הסופר אי אפשר
האם זה גזירת הכתוב שממון יותר חמור מצער הנפש