מהות המצוות

שלום הרב,
לאחרונה עלו לי כל מיני שאלות (או בעצם שאלה אחת ארוכה) ואשמח אם הרב יוכל להתייחס.
כשהתורה מצווה על מצווה מסויימת, האם היא באה להדריך אותי לגבי מהות כלשהי או שהציווי הוא על מעשה ספציפי שאינו מרמז דווקא על מהות כללית?
אתן דוגמא, למשל מצוות שבת, ניתן ללמוד אותה כאוסף של פרטים טכניים שהאדם צריך לעשות או לא לעשות או כאיזשהו ציווי על דרך חיים של "להתנתק, לעצור כדי להתמלא וכו'" וממילא מתוך כך כל ההתייחסות אל השבת היא אחרת?
דעתי נוטה לומר שהתורה מכוונת אל המהות (וישנן הרבה דוגמאות שיוכיחו, כיבוד הורים, לא תרצח, לא תגנוב…)
אבל בכל זאת ישנם מקרים ביהדות שנראים סותרים רעיון זה, פרוזבול (שמבטל במקום מסויים את הרעיון המהותי של שמיטת חובות), כבילה של המערכת ההלכתית משפטית למצב בו אף פעם לא ייסקל מחלל שבת, נתינת אפשרות לנשים להעיד אם בעלי הדין מאפשרים זאת (אופציה זאת לא הייתה אפשרית אם הייתה בעיה מהותית בעדות אישה).
מתוך הקדמה זו יש לי שלוש שאלות:
1. איך ניתן לדעת אם הסקה מהותית כלשהי היא אכן כוונת התורה? אם היא מתיישבת אצלי? אם גדולי הרבנים סוברים ככה?
2. ‏האם ניתן לפסוק לפי הסקה מהותית שנובעת מהתורה למרות שהיא לא הלכה מפורשת?
3.האם זה תלוי מצווה? יש מהותיות ויש נקודתיות?
השאלה נובעת בעיקר מהיחס ללהטבים, אני חושבת שבעצם נעשה איזשהו היסק מהתורה שהציויים הנוגעים לדבר מביעים משהו יותר עמוק ומהותי על יחסים בין איש לאישה, משפחה ונישואין.
השאלה היא אם אין איזשהו מקום להגיד שאולי במקרה זה מדובר על איסור נקודתי (שהוא אכן איסור) אבל לא צריך להשליך ממנו הלאה ולאסור כל קשר של זוגיות כזה (שלא חייב לכלול את האיסור עצמו).
האם אי אפשר לומר שיש בידינו בחירה כיצד לפרש את האיסור (כמהותי או נקודתי)?
האם הרב חושב שבחירת הפירוש עשוייה להיות תלויה בגורמים חיצוניים,נניח היהדות מנסה ליצור קונטרה לתרבות המערב ולכן בוחרת ללכת לכיוון השני ממנה? השאלה נובעת בעיקר בגלל העובדה שיש לנו תקדימים לדברים שפורשו בעבר כמהותיים אבל כיום מנסים לטעון שהם לא כאלה (בעיקר בתחומים של יחס לנשים)
כיוון שהשאלה ארוכה אבין אם לא יהיה ניתן להתייחס אליה במסודר, אם לא אפשרי אשמח להפניה למקורות שונים בנושא.
תודה רבה בכל מקרה ויום טוב.
‏