אין עונשין מן הדין

שלום הרב,
ראיתי בתשובה קודמת שרשמת שיש מחלוקת האם בק"ו מסוג של "בכלל מאתיים מנה" אומרים את הכלל שאין עונשין מן הדין או לא.
שאלתי היא – כיצד ניתן לומר שבקל וחומר מסוג זה לא חל הכלל של "אין עונשין מן הדין", והרי כל עיקרו של הכלל שאין עונשין מן הדין נלמד ממקרה של בכלל מאתיים מנה.
כפי שמובא במסכת מכות דף ה ע"ב – 
"לימדתנו רבינו שאין עונשין מן הדין דתניא (ויקרא כ, יד) איש אשר יקח [את] אחותו בת אביו או בת אמו אין לי אלא בת אביו שלא בת אמו ובת אמו שלא בת אביו בת אמו ובת אביו מנין ת"ל ערות אחותו גילה עד שלא יאמר יש לי בדין אם ענש על בת אביו שלא בת אמו ובת אמו שלא בת אביו בת אביו ובת אמו לא כל שכן הא למדת שאין עונשין מן הדין"
הרי אחותו שהיא גם בת אביו וגם בת אמו כוללת בתוכה אחותו שהיא רק בת אביו או רק בת אימו, כלומר בכלל מאתיים מנה, ואף על פי כן זהו המקור לפי הברייתא לכך שאין עונשין מן הדין?