התחשבות ההלכה במוסר

העובדה שהלכה ומוסר אלו שני קטגוריות שונות, האם זה אומר שההלכה לא מתחשבת במוסר ? כלומר, שהנורמות ההלכתיות הן תמיד לא מוסריות (״לא״ לא במובן שהן נגד המוסר) ? אם כן, איך זה מתיישב עם כך שההלכה מכירה בעקרונות-על של ״כבוד הבריות״/הפסד מרובה/צער גדול/ וכו וכו ? הרי כאן ההלכה אומרת שאם נורמה כלשהי נוגדת עקרון-על (מוסרי) לפעמים יש לנהוג נגדה.