דין אנשים שאינם מאמינים בקב"ה

אנשי אקדמיה\דת שונים שעל-פי מיטב הבנתי את משנתם על אף ששומרים הלכה לא באמת מאמינים בקב"ה ובכך שבאמת ציווה את המצוות: האם אפשר לספור אותם למניין? כיצד לנהוג אם ממנים אחד כזה לש"צ? האם אפשר לענות להם לקדיש\קדושה וכו'? האם יש עוד דינים שחשוב לדעת לגבי אנשים כאלה?
לגבי אדם שאינני מכיר את משנתו לעומק אך יש לי ספק אם הוא אכן מאמין בקב"ה או לא, אפשר ללכת ע"פ חזקה\רוב ולהניח שהוא כן מאמין?